“喂,醒醒!醒醒!”
曾凡被叫醒的时候实验室外面已经天光大亮,看看计算机的时间,才刚刚五点多钟,计算机还在运行之中。
叫醒他的是实验室的负责人帕米拉教授,看他醒过来问道:“曾,你在搞什么?学校超算中心管理员给我打电话,说我们突然调用了大量超算资源进行计算,是你弄的吧?”
“教授,我昨天睡觉前突然萌生想法,写了一个程序,可以根据已经测出来的基因序列推算后面未知的序列,正在进行验证!”曾凡赶紧从座椅上站了起来说道。
“哦,你有多大把握?”帕米拉好奇的问。
“一半一半吧,第一步估计需要超算中心支持五到十个小时,后面的实际演算还需要一到两天时间,不太确定!”曾凡挠挠头说道。
“咱们的进度已经超前了很多,可以给你三天时间尝试,超算中心那边我会让他们配合!下次再有这事你提前通知我,别再这么鲁莽!”帕米拉笑着说道,这个学生总给她带来惊喜,必须得支持啊。
“知道了,谢谢教授!”
接下来的两天,曾凡大部分时间都泡在实验室的电脑前,盯着程序的运行,这个基因组测序软件,只是他的一个尝试,为后面的基因功能模拟程序做的一个前期测试。
那个程序不仅要包含这个测序部分,还要能模拟基因的分裂复制,怎么样
通过基因转录生成不同的氨基酸,再根据碱基序列用氨基酸组成结构不同的肽链,最后将肽链转换成特定功能的蛋白质。
通过这些不同的蛋白质来调控生物体内各种不同的生物酶,激素,抗体的产生,进而控制生物体的生长,发育,新陈代谢和其他本能行为。
程序的最终状态曾凡不知道什么时候能完成,需要的数据太多了,涉及到的算法也太庞杂,他初步目标是先模拟一部分基因的功能,模拟实现转录生成氨基酸,再到产生蛋白质的过程,也就是基因功能测试中,最复杂的细胞实验这部分。
假如这部分功能可以实现,即便后面不能完成,也可以大大提升以后基因功能测试的效率,降低参与这项研究的门槛,加快基因功能破解的整体速度。
基因序列的推算比预想中顺利,第三天的早上就全部完成了。
根据最开始公布的基因组草图,这两年多几个国家的几十个实验室互相配合已经完成了百分之七十以上的测序工作,未知的只有百分之二十多。
程序推算出来的结果当然不能当作测序结果,可以对这个结果进行测试,如果准确率能得到验证,那将提升整个测序工作进度,好处不言而喻。
帕米拉随后调整了各小组的测序任务,对这个推测出来的结果进行验证,证实了程序的可靠性,那就可以向上提交,测序工作有望今年内全部完成。
“曾,结果验证你就别参与了,这几天你专注你那个基因功能测试实验吧,论文好好写,别浪费这次机会!”帕米拉对曾凡说道。
“教授,我对一些基因转录的细节不太了解,想重做一遍细胞实验,你看可以吗?”曾凡问道。
“当然可以,该有的实验计划也要有!”
“我已经写好了!”
看了曾凡的实验计划后,帕米拉签字表示同意,对他的实验给予了全力支持。